Nome da disciplina: Introdução ao geoprocessamento para Etnobiologia e Conservação da Biodiversidade
Docente responsável
Prof. Thiago Gonçalves Souza
Docente externo convidado
Prof. Maurício Vancine (UNESP- Rio Claro)
Período
30/09/2019 - 04/10/2019
Créditos
45 horas (3 créditos)
Vagas
15 + 5 especiais
Resumo
A disciplina oferecerá os principais conceitos teórico-práticos introdutórios de geoprocessamento aplicado à Ecologia. A parte prática será desenvolvida através de ferramentas na linguagem R e do software QGIS. Serão abordados os seguintes temas: (i) controle de versão, Git e GitHub, (ii) introdução e funcionamento da linguagem R e do software RStudio, (iii) estrutura e manejo de dados na linguagem R, (iv) introdução ao tidyverse, (v) visualização de dados, (vi) estrutura e fonte de dados geoespaciais, (vii) introdução e funcionamento do software QGIS, e (viii) estrutura e manejo de dados geoespaciais na linguagem R. A carga horária total será de 45 horas, onde nos cinco dias iniciais serão ministrados 6 horas teóricas-práticas, num total de 30 horas. As 15 horas restantes serão direcionadas à realização de exercícios práticos, que serão aplicados remotamente como forma de avaliação para compor a nota final da disciplina. Após a realização da disciplina, espera-se que os alunos adquiram conceitos gerais da estrutura e manipulação de dados espaciais, assim como domínio das técnicas e métodos para alcançar autonomia e produzir soluções para suas próprias questões relativas ao geoprocessamento.
Datas e horários
Teórico-prático: 30/09 – 04/10 [09:00 h - 12:00 h | 14:00 h - 17:00 h] (30 horas)
Exercícios-atividades assistidas remotamente: 07/09 – 11/09 (15 horas)
Local
Ementa
pdf
Contato
Para mais informações ou dúvidas, envie e-mail para Maurício Vancine ([email protected])
Hardware
Será necessário que todos tragam seus próprios notebooks
Softwares
R, RStudio, QGIS e GRASS GIS
-
Instalar a versão mais recente do R (3.6.1) e RStudio (1.2.5001)
Vídeo de instalação do R e do RStudio
Curso da linguagem R -
Instalar a versão mais estável do QGIS (3.4 LTR)
Vídeo de instalação do QGIS
Curso Básico de QGIS
Curso de QGIS 3.6 - MasterGIS -
Instalar o git
Vídeo de instalação do git
# r
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/" # mint 19 ou ubuntu 18
sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu disco-cran35/" # ubuntu 19
sudo apt update
sudo apt install -y r-base-core # r
sudo apt install -y r-base-dev # devtools
sudo apt install -y libssl-dev # tidyverse
sudo apt install -y libxml2-dev # tidyverse
sudo apt install -y libcurl4-openssl-dev # tidyverse
sudo apt install -y libgdal-dev # gdal
sudo apt install -y libproj-dev # gdal
sudo apt install -y libudunits2-dev # units
# rstudio
wget https://download1.rstudio.org/desktop/bionic/amd64/rstudio-1.2.1335-amd64.deb
sudo dpkg -i rstudio-1.2.1335-amd64.deb
sudo apt install -fy
rm rstudio-1.2.1335-amd64.deb
# qgis
sudo add-apt-repository ppa:ubuntugis/ppa && sudo apt update # mint 19 ou ubuntu 18
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 6B827C12C2D425E227EDCA75089EBE08314DF160 # ubuntu 19
sudo add-apt-repository "deb http://ppa.launchpad.net/ubuntugis/ppa/ubuntu bionic main" # ubuntu 19
sudo apt install -y qgis qgis-plugin-grass
# git
sudo add-apt-repository ppa:git-core/ppa && sudo apt update
sudo apt install -y git
Instalar os pacotes no R
Com o R e o RStudio instalados, baixe esse script (scripts são roteiros que possuem comandos, como um rascunho).
Abra o script baixado (script_install_packages.R) no software RStudio e rode cada linha de comando para instalar os pacotes.
Para rodar as linhas, basta colocar o cursor na linha de código a ser executada e precionar: Crtl + Enter, como mostra o gif abaixo:
